DeepMind 公司（后被谷歌收购）凭借其第一版蛋白质结构预测工具

　　（Critical Assessment of Structure Prediction，CASP）竞赛中，至多呈现了5项卵白质设想角逐，参赛者大多利用人工智能（AI）东西，从头设想出全新卵白质，以做为更无效的药物、工业酶或尝试室试剂。但卵白质设想范畴的繁荣正在很大程度上形成了一些紊乱，AI东西设想卵白质的速度远超正在尝试室制制和测试它们的速度，这使得人们很难判断哪些设想方式或者东西实正无效。范畴，例如，AlaphaFold2 就是正在第14届CASP竞赛中一和成名。而现正在，一系列新角逐通过降低进入门槛吸引了来自世界各地的人们进入卵白质设想相关范畴。但一些科学家指出，这些竞赛必需降服一些妨碍，例如确定要处理哪些问题，以及若何客不雅地选出获胜者。不然，这些竞赛反而会对卵白质设想范畴形成损害。卵白质设想角逐的部门灵感来自于一场起头于30年前的竞赛，这一竞赛帮帮了生物学人工智能的。（Critical Assessment of Structure Prediction，CASP），该竞赛始于1994年，每两年举行一次，由马里兰大学的计较生物学家John Moult和大学戴维斯分校的计较生物学家Krzysztof Fidelis，该竞赛旨正在挑和从卵白质的氨基酸序列计较预测其卵白质三维布局，预测布局取实正在布局最接近者获胜。2018年，DeepMind 公司（后被谷歌收购）凭仗其第一版卵白质布局预测东西正在昔时的CASP竞赛中成为第一名。两年后，新一代的AlphaFold2表示可谓炸裂，以致于CASP竞赛的人John Moult就地颁布发表——预测简单卵白质布局的问题根基上处理了。现在，CASP竞赛的核心曾经转移到了新的挑和上，例如，预测一个复合体中多个彼此的卵白质的布局。现正在，很多人但愿新呈现的卵白质设想角逐可以或许鞭策卵白质设想范畴的成长，正如CASP竞赛帮帮激发了卵白质布局预测的一样，若是没有CASP竞赛，就不会有AlphaFold。博得了国际科学非营利组织“立异联盟”（Align to Innovate）举办的卵白质工程锦标赛（Protein Engineering Tournament）。该竞赛分为两轮，起首，参赛者要预测分歧酶变体的特征，正在这一轮表示最好的那些团队正在第二轮中测验考试从头设想一种可以或许分化淀粉的酶，通过尝试室验证来确定最佳设想者。本年4月份，生物手艺公司Liberum Bio和卵白质设想东西Rosetta的科学家集体Rosetta Commons配合举办了，并颁布发表了获胜者，参赛者被要求从头设想一种现有的卵白质——一种普遍用于卵白质纯化的动物病毒酶，以使其更高效。则是要求设想出一种用于CAR-T细胞医治的卵白质，按照设想卵白取抗原靶点的连系、通过CAR发出信号、激活CAR-T细胞增殖和杀伤反映的程度来评选获胜者。一项比来推出的卵白质设想竞赛尤为惹人瞩目——（Evolved 2024）西安证件制作，该竞赛的获胜者将获得价值25000美元的亚马逊云办事以及OpenAI等公司的价值数千美元的办事。对于卵白质布局预测竞赛，对的评估很简单——预测取通过尝试解析的实正在布局的类似程度。而对于卵白质设想而言，评估的尺度明显复杂的多，例如，若是要求设想一种卵白酶，设想出来的酶的活性、不变性以及对卵白质的水解效率，都影响对设想的评估，因而，需要从多个维度进行评估，这就导致确定获胜者并不容易。正在颁发的一项报道中，本年8月份，卵白质工程师Alex Naka他的笔记本电脑和大约80个基于云计较的AI处置器，设想了几十种卵白质，这些卵白质旨正在靶向中发生突变的受体——EGFR（表皮发展因子受体），他选出了此中最有前景的10种设想，加入了一项新的卵白质设想竞赛，并登上了排行榜榜首。然而，9月下旬发布的竞赛让他很失望，他设想的这10个卵白看起来很超卓，但没有1个正在尝试室中显示出结果，147种设想中专业制作各种证件，只要5个能取方针受体连系，此中以至有50个设想的卵白质压根就无法制制出来。